Сусуманский район в составе Магаданской области образован в 1953 году. Город Сусуман образован в 1964 году из одноименного рабочего поселка.
Флаг города Сусумана утвержден Решением №27 Собрания Представителей Сусуманского района 22 февраля 2002 года. В основе флага (и утвержденного в тот же день нового городского герба) старая эмблема города Сусумана, утвержденная в 1974 году. Полотнище флага состоит из двух полос: красной, широкой, с изображением машины, добывающей золото, жёлтого цвета; и синей, более узкой. Флаг символизирует основную отрасль, развитую в районе - золотодобычу.